恐龙灭绝之后，地球的中生代结束，新生代（约6500万年前至今）开始了。作为地球历史上最新的地质时代，它可以分三个纪：古近纪、新近纪、第四纪。到第四纪的时候，哺乳动物已经成了地球上占据支配地位的生物，其中就包括蝙蝠。

人类也属于哺乳动物，但人不会飞。不仅人不会飞，狗、猴、虎、狼、熊猫这些哺乳动物也不会飞。而蝙蝠则属于哺乳动物中的一朵奇葩，因为它是这个群体里唯一的空军。从外表看起来，蝙蝠就像长了翅膀的老鼠。

但蝙蝠和老鼠的关联度其实不大。而且，蝙蝠很容易被误解为鸟类，其实它应当是哺乳动物兽类，不能因为人家会飞，就把它归到鸟群里去。一直以来，蝙蝠祖先是谁都是古生物学家非常感兴趣的问题，研究这个问题，也是在研究地球生物的大进化历史。

首先，蝙蝠不是老鼠进化来的，也不是翼龙进化来的。翼龙，这名字听起来很像恐龙里的一种，但人家只是跟恐龙同时代生活而已；不过翼龙是第一种可以飞的脊椎动物，和蝙蝠一样体上有毛，有和鸟类相似的生活习性。

翼龙与蝙蝠都有皮膜一样的翅膀，但进化源不同；翼龙能四足着地走路，蝙蝠的后肢没什么力量，到地上就只能扑腾；翼龙从地上弹射起来就能飞，蝙蝠还得先挂在树上，借助重力下坠让自己飞起来。恐龙灭绝后，翼龙也灭绝了。

前面说过，恐龙（非鸟恐龙）生活在中生代时期。中生代结束，恐龙翼龙都消失，一直被它们压制的哺乳动物就在地球上撒起了欢，蝙蝠也出现了。现代生物考古发现，距今5220万年前的两种早期蝙蝠——伊神蝠和爪蝠，已经有了飞行的特征。

世界上最早的蝙蝠化石就来自伊神蝠，它跟现代蝙蝠有点不一样，它翅膀偏窄短，又能飞又能滑翔，而且后肢很有力量，可以攀援树枝，不像现代蝙蝠那样无力。只是除了伊神蝠化石外，2006年，我国古生物学又在内蒙古宁城发现了神奇的“远古翔兽”化石。