庙内供奉碧霞元君、眼光娘娘、子孙娘娘、东岳大帝、玉皇大帝、关帝、药王等神祇。全庙沿中轴线依次排列的主体建筑有山门殿、天王殿、娘娘殿、东岳殿、玉皇殿，共有四进院落市级文物保护单位。庙内有万历年间铜炉1座，宣德年间铜钟1座，钟、鼓楼各1座。

由于它位于奥运主场馆区内，与国家体育场、国家游泳中心毗邻，形成了古典与现代相辉映的场景，是人文奥运精神的重要体现。是奥林匹克公园的一部分，现为北京民俗博物馆分馆。

五顶八庙中的五顶庙是北京最著名的五座泰山神庙，亦称碧霞元君庙，分别为东顶、西顶、南顶、北顶、中顶。东顶，在东直门外。南顶，位于丰台区大红门外南顶村，建于明代。现在东顶和南顶已毁不复存在。西顶也称广仁宫，位于海淀区四季青镇蓝靛厂，为明正德朝创建的嘉祥观。北顶，即本文所指的娘娘庙。中顶在右安门外的草桥，现存有山门、大殿以及石狮和前人书写的篆字匾额、撰文石碑。北京的八庙是指太庙、奉先殿、传心殿、寿皇殿、雍和宫、堂子、文庙和历代帝王庙。