触须可达37米的狮鬃水母

往下是200-1000米深度的海洋中层，作为透光的上层和完全黑暗的深层之间的过渡带，本就微弱的光线在这个水层随着深度增加而逐渐消失，而些许的光线也不足以进行光合作用。中层带的生物群落普遍体型较小，像灯笼鱼科、褶胸鱼科、头足类、磷虾和其它甲壳类动物通常只有几厘米到十几厘米的样子。

斑点灯笼鱼

由于该层无法进行光合作用，这里环境较上层严苛得多，食物网的维系有赖上层供给营养，许多生物抓住一切机会摄取上层水域降落下来的有机物质。上层有机物质主要以絮状物形式沉降下来，在探照灯照射下像极了雪花，我们形象地将其称之为"海雪"。

不过，处于中层的海洋生物还可以通过另一种途径吸收上层水域的养分，那就是晚上垂直迁移到表层，在富含养分的上层水域觅食，白天再回到深水，躲避更大的掠食者。因此，这个生态系统在碳循环上可以说是极具效率的，它拥有极高多样性和生物量的鱼类、头足类和甲壳类，能够为远洋地区的上层大型掠食者提供重要的食物来源，比如一些远洋鲨鱼、鲸豚有时会下潜数百米前往中层水域进食头足类和鱼，而抹香鲸这样的深潜型鲸鱼为了觅食更是频繁进入中层，可以视作中层生物群落的过渡成员。

最重的硬骨鱼：翻车鱼

虽说比不上表层，中层带也有巨型海生动物，现今最重的硬骨鱼——重达2.3吨的翻车鱼过去一般被认为是典型的上层鱼，但近年来有研究显示翻车鱼比以往认为的更频繁地潜入中层；最长的硬骨鱼——长达8米的皇带鱼就可以算作中层鱼（严格地说它是上层中层都有分布）；而两种巨型鱿鱼——275千克的大王鱿和将近500千克重的南极中爪鱿在这个深度已有分布，当然，两者的生境也包括下一个水层。

大王鱿，中层水域的顶级掠食者

接着是水深1000-4000米的深海层，这里一片黑暗，生物发光是唯一的光源，如果说中层水域的动物们尚且具备强壮的肌肉进行追捕和长距离迁徙，这一深度的大多数生物，其肌肉已经松弛到只适合原地等待猎物主动送上门，极为缓慢的代谢也正是对这种恶劣环境的适应。