芝麻种子小，繁殖系数高，最少每公顷播种用种量1.5千克即可，且播种技术简单，容易为生产者所掌握。芝麻的花器大，便于人工授粉制种操作。
（1）制种方案。制种地应高燥平坦、灌排方便、无遮阳、阳光充分照射，最好选用沙壤或壤土作制种地。制种地的规模按父、母本比例，人力与需要量而定。一般父母本比例为1：2或1：3，即1公顷父本区需2~3公顷母本区。芝麻从始花到终花期需30~50天，每公顷制种田需临时工45~ 60人。在盛花期需要60人。杂交种子需要量按1：100计算，即制种1公顷可供100公顷播种。若杂交种子经过大粒化、丸粒化后，制种1公顷可供200公顷播种。制种地设计，可将每公顷地分成相等的若干个小区，两端的小区为父本区，随后父本区与母本区交互排列。每小区行长、行距设计要方便操作，采用宽窄行，宽行60厘米，窄行30厘米，株距10厘米。
（2）去雄与授粉
芝麻人工去雄的时间，一般是在当天下午4时后，由于芝麻是无限花序，具有不断开花不断结蒴的生物学特性，一般花是自下部向上部逐渐开放。当观察到母本植株下部花蕾的花冠开始伸长，花色由淡绿转变成白色或淡紫色时，预示明晨即将开放。此时用手将这种即将开放的花冠提起去掉，附在花冠筒部内侧的4枚雄蕊也随之去掉。去雄后，雌蕊的柱头裸露。是否要在去雄花蕾上罩1个透明玻璃纸，以防异交，这取决于制种地的具体情况，一般无风和少蜂类地不要罩。
芝麻人工授粉的时间是在第2天早上进行。人工授粉采用两种方法。一种是取父本刚开放的花冠罩在母本已去雄的柱头上，在罩花冠时轻轻挤压花冠筒部，使花药破裂，花粉散出，花粉就落在柱头上，这种授粉方法在小面积制种时使用适宜。另一种方法是将毛笔的笔毛剪平，配备-一个培养皿和一把小剪刀。如有露水，把培养皿放在阳光下晒15分钟左右。用毛笔轻压花药使其破裂，散出的花粉粘附在毛笔前笔毛上，用此粘附有花粉的毛笔在母本区逐行给每-一个已去花冠的柱头授粉，使芝麻叉状柱头都粘上花粉。这种授粉方法适合大面积制种。
（3）打顶
打顶的目的是要打掉一些虽然可结蒴果但不能成熟的花蕾，以防止养分浪费，保证制种蒴果发育良好。打顶的时间是在收获期前20天，将花蕾带顶尖统统打掉。打顶的方法，可用手掐去，因为顶类幼嫩，一掐即可，但注意勿撕裂植株表皮。也可用剪子打顶，将5厘米左右长的顶尖剪掉。用剪子打顶快，质量高。
