主要以幼虫态危害梨树的花丛、芽及果实。

在梨树的芽刚刚开始萌动时，越冬幼虫就会开始食害梨树的叶芽及花芽，造成芽枯死，并具有转芽危害习性。

幼果期蛀果后，常用丝将果缠绕在枝条上，蛀入孔较大，孔外有虫粪，被害果果柄和枝条脱离，但果实不落。

防治时应在冬季清园时将一些带虫的梨芽予以剪除，以降低虫口基数；4月份中旬，结合药剂防治，可选择溴氰菊酯、高氯·甲维盐、阿维菌素等。

主要危害梨果。

幼虫从梨萼、梗洼处蛀入，直达果心，高湿情况下蛀孔周围常变黑腐烂，俗称“黑膏药”，蛀果孔的四周有虫粪。

由于梨小食心虫通常在树干基部、树干翘皮处结茧越冬，所以早春时分，应将梨树的老树皮刮除干净，将果园的落叶彻底清扫并且烧毁；在桃梨混栽区注意在春夏季剪掉受害桃梢，及时套袋；药剂可选用氯虫苯甲酰胺、溴氰虫酰胺、啶虫脒、高效氟氯氰菊酯等。