《大鱼海棠》的灵感来源于《庄子·逍遥游》中的“北冥有鱼，其名为鲲，鲲之大，不知其几千里也”。

讲述了一个掌管植物的少女与人类男孩“鲲”的灵魂的奇幻故事。

影片《大鱼海棠》发生的场景源自中国客家土楼，主人公椿是一个居住在“神之围楼”里的女孩，在十六岁生日那天变作海豚到人间巡礼，却被大海中的渔网困住，挣扎中被一个人类男孩所救，而男孩却落入深海死去。为了报恩，她开始在神的世界里秘密饲养那个男孩的灵魂---一条拇指大的鱼，直到有一天，它成长为江河也不能容下的鲲并回归大海，男孩终于获得重生，但这一过程却不断地违背“神”的世界规律而引发种种灾难……