食用菌种的保存是一重要的问题。保存的目的是为以后继续研究和生产上的应用，因此，保存的方法是使菌种在长期内置放不致于死去，同时还要尽可能使菌种能保持原有性状。菌种保存的方法很多，可根据研究或生产应用的需要，要求保存时间的长短，菌种本身情况，灵活选择其方法：

（1）临时保存法对于暂时还不接种的菌种可采用，将酒种移植在斜面试管中，待菌落充分生长后，用软木塞或橡皮塞将管口塞紧，这样可以较长时期培养基不致干燥，用起来也很方便。

（2）冰箱保藏法将菌种接种在固体斜面培养基上，待菌落充分生长后，放在4℃的冰箱中进行保藏。每隔一定时间转接一次。一般用这种方法可以保存半年左右。

（3）地窑保藏法挖一米深的地窖，窖内放一个缸，在大缸内再放一个小瓦缸，在大小瓦缸间隙周围放河沙，用井水把河沙浸湿。井水要经常更换。在小缸中放几个大口瓶，把要保存菌种放入大口瓶中，然后盖上玻璃瓶口，盖好缺口保存时间约3个月到半年。

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