南方医科大学南方医院

陆军军医大学第一附属医院

海军军医大学长海医院

总体上来看，军医大学附属医院排名靠前，部队总医院略逊于军医大学附属医院。只有中国人民解放军总医院是最牛的，比所有军医大学附属医院都要强。

战区总医院中排名最靠前的是东部战区总医院，它坐落在南京，就是以前的南京军区总医院，虽然最新排行榜上排名全国第58，但在之前也排进过前25名以内，在南京是可以和江苏省人民医院、南京鼓楼医院比肩的优质医院。它的肾脏科是全国第一。

东部战区总医院

另外几家战区总医院分别是位于沈阳的北部战区总医院、位于武汉的中部战区总医院、位于成都的西部战区总医院、位于广州的南部战区总医院，这四家医院的整体实力和中国人民解放军总医院、东部战区总医院有一定差距，但也是相当不错的医院，在当地有一定的影响力。