运气学是我国古代是研究自然气候规律对生物、对人体生命影响的学说。包括天文学、气象学、物候学、历法学、医学等等多学科。

五运六气是古人以天干、地支、阴阳、五运、六气来推算60年疾病的发生、预防、和治疗规律的学说。从理论学说看玄奥可观，但是多充满机械论和先验论。不但现代人难以接受，也很少被古人采纳。但此学说在宋代一度非常盛行。

五运是指丁壬木、戊癸火、甲乙土、乙庚金、丙辛水五个阶段的相互推移。

六气是指厥阴风木、少阴君火、少阳相火、大阴湿土、阳明燥金、太阳寒水六种气候的转变。

五运六气根据天文历法推算出一个年度和季度的气候、物候变化，天人合一的人体反应，及疾病流行状况。并以此做出治疗决策。

古今对《伤寒论》各有所见，有人认为《伤寒论》有四时八节、二十四气、七十二候决病法以应天人合一，认为五运六气是解释《伤寒论》的唯一的方法。《伤寒论》六经中揭示了天地人运行规律及对人体脏腑经络气血的影响。《伤寒论》中阳是六腑，阴是五脏，六腑相应十二支，是六气。五脏应的是天干，是五运。六腑为阳主气，五脏为阴主血。《伤寒论》太阳病，头痛至七日以上自愈者，以行其经尽故也。这说明行经是一日一经，六经走一遍回到起点正好七日。田和禄《五运六气解读伤寒论》 认为《伤寒论》的理论体系是五运六气。

持不同意见的代表章太炎，《章太炎全集》假借运气，附会岁露，以实效之书变为玄学。闫德润《伤寒论评释》自金(代)以来解《伤寒论》者多矣，然多误于玄学 ，妄假运气，此玄谈运气之说，可谓一言中的，甚确。认为用五运六气来解释伤寒论是思辨的方法，没有可信的实践支撑的理论证据。所以否认用五运六气解释《伤寒论》。笔者认为用五运六气来解释《伤寒论》有些玄奧，没有大的医道很难驾驭，还是六经辨证才是王道。