矮脚猫由于四肢比较短小，不利于爬跨配种，所以第一次配种时可能需要人工进行辅助配种。一个人将母猫扶住，另一个人帮助公猫进行爬跨配种。一般第一次配种成功之后就不需要再进行人工辅助配种了。同时注意矮脚猫最好不要和矮脚猫进行配种，可以选择体型较小的正常猫咪，以免出现遗传性疾病。

曼基康短脚母猫可以繁殖，不过需要特别注意，确保公猫的营养水平，在配种时给予一定的协助，选择与曼基康短脚猫体型接近的猫进行配种，因为曼基康短脚猫的四肢短，公猫会不好爬跨，并且曼基康短脚猫容易出现遗传性疾病。