一、版本的区别：孢子为孢子游戏的正统本体版本，而孢子银河大冒险是涵盖了孢子游戏本体和银河大冒险的资料片，孢子银河大冒险是孢子的游戏扩展版本。

二、游戏界面的区别：孢子银河大冒险的主菜单新增银河冒险一栏，而孢子原版中是没有的。玩家可以选择银河冒险一栏进行资料片游戏。

三、游戏内容上的区别：孢子银河大冒险在游戏内容上，新增了太空阶段的星球表面探险任务和任务编辑器，该任务编辑器比起孢子原版的任务编辑器更为的简单快捷，很适合新手玩家操作。而新增的十个探险任务也是十分有趣的。

四、生物进化等级的区别：在孢子银河大冒险资料片中，新增了几十种昆虫骨头型生物四肢，而生物的最高进化等级由原本的太空进阶升级到太空船长，连同生物编辑器中也有新增的船长装备等。

五、游戏模式的区别：孢子原版中是没有冒险模式的，而孢子银河大冒险中新增有冒险模式，冒险模式可以由玩家自己通过任务编辑器制作后，再进行游戏。而孢子原版只能进行剧情模式。

六、游戏耐玩性的区别：原本孢子中，由于孢子的组件不多，加上没有大冒险的模式导致游戏比较单一。而孢子银河大冒险不单单是游戏模式的增多提升了游戏的耐玩性，加上孢子组件的丰富让玩家有更多的创造可能。