金陵十三钗最后的结局是惨烈的，，13个人经历了噩梦般的折磨，有几人反抗日军而被*，剩下的人被送去了慰安所，在几年后受尽折磨而死，，仅仅只有玉墨活了下来，还在1946年以证人身份，指正侵华日军罪行！

结局中，以玉墨为首的金陵十三位青楼女子代替那些未经世事的女学生被送往了日军部落，最终下场不得而知

而神父约翰·米勒就把女学生装在大卡车车厢里，上面盖了好多木板。还有几箱红酒，用来引诱日本人。后来到关卡的地方，神父拿出通行证，红酒被日本人扣留了，女学生顺利逃走了。