关于这个问题，其实并没有真正说明过

在剧场版3中基德假扮白鸟警官是发现的，柯南也说“签上的话灵验了，是被白鸟警官发现的吗？”在结尾基德假扮新一出场，与柯南对话中有这样一句：“我为什么要在这个时候，解救一个棘手的敌人”更是充分体现出了他已经知道他的身份。

在剧场8中，柯南与基德在楼顶对决，基德模仿小兰的声音叫柯南，之前说了这么一句话“你的恋人已经做好晚餐等你回去吃呢”基德如果不知道柯南就是新一的话怎么可能会怎么说？再怎么开玩笑也不会把17岁的女孩和7岁的男孩在一起乱配对吧！

在剧场版10侦探们的镇魂曲中开头还是那经典的一段“我是高中生侦探工藤新一…………”其中介绍“知道我身份的有”最后一句话是这么说的“还有一个人——怪盗基德！（插话：背景音乐和基德的背影配合得妙，衬托出基德的神秘和看透一切的心思）任何事情只要跟他扯上关系就麻烦了！”

所以，应该是M3世纪末的魔术师，结尾基德装成新一帮柯南解了围

不看剧场版的话，76名侦探柯南VS怪盗基德，基德也说过，小弟弟，你不是一般的小孩吧，但是后面就没有什么了