1271年(元世祖至元八年)，忽必烈定国号为元，上都城和大都城成为元朝交替使用的两个都城，经历十一帝，107年。每年春分元帝即从都城大都前往此地，秋分时返回都城大都。1279年（元世祖至元十六年），元朝灭南宋。

从1271年到1368年，元朝国祚97年。

【明朝】

1368年，朱元璋定都南京，定国号“明”。同年明军将领徐达攻克大都，元顺帝退守上都，元朝灭亡。1369年，明军将领常遇春攻克上都。

1399年，驻守北平的燕王朱棣，以清君侧为名起兵，史称“靖难之役”。1402年，燕王朱棣攻至应天（今南京），建文帝不知下落，朱棣即位，为明成祖。

当时北元（包括蒙古各部）虽然大势已去，但仗着骑兵优势多次*扰明朝边境，仍然是明朝最大的威胁。明朝北线防御体系从西边的甘肃到辽东绵延万里，北平已成为明朝北方防御体系的最前线之一。

1403年，朱棣改北平为北京，名顺天府，随后迁都北京，天子守国门。京师（北京）周边部署重兵，与辽东、宣府、大同等互相呼应，足可巩固北线防御体系，御敌于国门之外。

从1368年到1644年，明朝国祚276年。

【清朝】

1583年（明朝万历十一年），努尔哈赤的祖父觉昌安、父亲塔克世在古勒城被明军*死，明廷下诏表示是误*，同时授予努尔哈赤敕书三十道、马三十匹和都督敕书。努尔哈赤便以盔甲十三副、部众数十人起兵。

1588年（明朝万历十六年），努尔哈赤统一建州女真。1616年（明朝万历四十四年），努尔哈赤在赫图阿拉正式建国，国号“大金”，史称“后金”。

1621年，努尔哈赤攻占沈阳城。1635年，皇太极打败林丹汗，取得元朝的传国玉玺，漠南蒙古各部向后金臣服。1636年，皇太极改国号为“大清”，成为清朝开国皇帝。

1644年（明朝崇祯十七年），李自成率军攻入北京，崇祯皇帝朱由检缢死于煤山东麓一株老槐树上。吴三桂开路，满清八旗入山海关，进占北京并定都于此。

1661年，清军攻入云南，吴三桂追*逃亡缅甸的永历帝，南明亡。