大多数着色杂质的微夹杂物，最初与SiO一起沉淀2并在结晶过程中使用一种“自清洁过程”沿着后期玉髓的结晶前沿排列，这个过程导致许多玛瑙中微内含物的典型壁平行排列。

沿着所谓的“逃逸管”的这种带状变形表明，矿物内含物在最终结晶过程之前已经固定。因此在从无定形SiO过渡的过程中，似乎发生了通过这些逃逸管的脱气。

2-凝胶到结晶玉髓，因为沿这种结构的玉髓纤维几乎没有变形，然而在某些玛瑙样品中，也有迹象表明，一些杂质在玉髓结晶后通过渗透进入玛瑙。

在玛瑙样品中，针铁矿和赤铁矿的微内含物表明了这一点，在选定的玉髓带的孔隙空间和同一玛瑙内的次生裂缝中检测到相同的矿化。

由于在这种内含物的渗透形成之后沉淀了另一代微晶石英，因此可以假设并非所有玛瑙都是在单个二氧化硅供应的连续过程中形成的。

根据最初的分析（拉曼光谱，EDS），在韦沃斯德尔迪亚博罗的玛瑙中，可以确定一个额外的含锆相，它似乎是锆石。在次生铁矿物堆积中出现这一阶段表明Zr矿物的形成较早。

来自韦沃斯德尔迪亚博罗玛瑙样品中“气泡”矿物内含物的 REM–显微照片

这种多级形成，表明腔体多次填充SiO，2CL研究也强调了含液体或结晶中断，可以检测到明显不同的玉髓世代，每个世代都是由与下一代边界处的独立球形生长引发的。

一些玛瑙中多个二氧化硅填充的另一个迹象是次生裂纹，它交叉切割了以前的玉髓层，随后又填充了新一代玉髓。

由于物理化学条件的快速变化，例如热液流体的二次供应，也可能形成不同的世代。