元朝只是当时的中国部分和中亚一部分，并不是最大，蒙古帝国那就大了，占了亚洲的五分之四外加欧洲的三分之一。

有些王朝的面积变化剧烈，例如汉朝，起初南不过浙江，北不过辽宁，西就到陇西，但是汉武帝以及他的曾孙和玄孙几朝的征伐，匈奴已经西逃，也就是说中亚以及北亚和新疆名义上都是汉朝的国土，但是王莽窜政后，就全都丢了。还有唐朝，最西到了里海，但是安史之乱后，全没了。

清朝对蒙古和新疆则不仅仅是保留军事实力，并且建立了实际的行政体制进行统治，特别是在新疆实行移民，更充实了中央政府的实际统治权利。正是因为这样，清朝才可以比以往朝代更牢固地统治这些区域，并且把其中大部分区域带入成为今天的中国领土。

所以清朝是疆域最大的。

要弄清唐朝、元朝和清朝到底哪一朝代疆域最大，首先要理清古代“疆域”概念和今天“领土”概念的不同。今天的“领土”是有严格的国界线来划分的，只要没有领土纠纷，面积都是相对固定的。但古代的“疆域”就不同了，它没有固定清晰的一条界线，大致相当于一个国家的实际控制范围。而且古代国家对疆域的控制方式又有不同，直接管理自不必说，除此之外还有统辖管理和羁縻管理等，按照不同的标准疆域的大小差别是很大的。另外古代“疆域”变动较为频繁，有的疆域可能只能维持几年，所以不同时期的“疆域”又有比较大的差别。所以我们只好比较极盛疆域。

唐朝的疆域在极盛时期为唐高宗龙朔年间，疆域东起朝鲜半岛，南抵越南顺化一带，西达中亚咸海以及呼罗珊地区，北包贝加尔湖至叶尼塞河下流一带。这包括了安西、安北、安东、安南、单于、北庭六大都护府，以及大量隶属于六大都护府的都督府和羁縻州，面积大约为1237万平方公里（其他还有更高的统计数字，主要差别在于是否把黑水靺鞨等介于藩属国和羁縻州之间的地方计算在内）。

元朝脱胎于忽必烈非正常继承汗位，其建立后宣告了纵横亚欧的蒙古帝国的彻底分裂，忽必烈在击败弟弟阿里不哥后基本上把草原和中国北方纳入疆域，后来灭南宋、参与瓜分察合台汗国，把南方和新疆一部分纳入疆域。与唐朝疆域的最大不同在于，西藏、东北正式归中央政府管理。元朝鼎盛时疆域面积约为1372万平方公里（1330年）。当然因西伯利亚疆界无法确定，故而无法得到十分准确的面积数据。

清朝前期收服了喀尔喀蒙古，入关后到康熙年间以直接驻军的方式解决了和硕特汗国，后又打败了沙皇俄国、台湾郑氏集团，乾隆中期灭准噶尔汗国，这样大清版图就包含了东北、蒙古、新疆、西藏、台湾岛，疆域空前庞大，国土面积达到1316万平方公里（1820年）。清朝的“开疆拓土”意义更胜前代，国家对边远地区进行了有力的统辖，对各民族地区都实施了有效的行政管理。当前新的中学历史教材着重突出清朝对我国现代疆域形成做出的贡献，不是没有道理的。

综上所述，将三个朝代的“疆域”机械排序的话，应该是元朝大于清朝大于唐朝，但以实际控制区域和实施有效管辖而论，我倾向于清朝大于元朝大于唐朝。