12.《战栗的乐谱》
不久之前发生了以音乐家为袭击目标的连续*人事件，被害人均出身于原著名钢琴家领衔创建的一所音乐学院。柯南等一行人，受到了这位钢琴家的邀请，出席由他出资建造的音乐厅的落成典礼音乐会。音乐会的亮点是巴赫弹奏过的管风琴和世界著名的斯特拉迪瓦里琴的音色，以及拥有绝对音感的天才歌手的歌声。可是，在音乐会正式举办前，陆续发生了许多可疑案件。而正式演出当天，柯南他们所在的音乐会会场突然发生了爆炸，陷入一片火海。
ps：斯特拉迪瓦里，活跃于17世纪的著名工匠安东尼奥·斯特拉迪瓦里所制造的小提琴。在世界上享有盛誉，由于数量及其稀少而价值连城。
13.《漆黑的追踪者》
一年一度的七夕即将到来，东京、神奈、静冈、长野等地却接连发生六起连环*人案，被害者身边皆留下麻将牌中的七筒和奇怪暗示。由于作案范围过大，各地警署探员纷纷聚到东京警署的专案组共同研究案情，毛利小五郎也被邀请参加，柯南则偷偷听取了会议的内容。会后，柯南无意中听到群马县警部山村操哼唱的童谣，继而发现有黑衣组织的成员混进警察中间。在一次围捕行动中，柯南遇到假扮人质的Vermouth，得知近期一连串的*人案件与存有组织内部人员资料的记忆卡有关。与此同时，潜入警察内部的间谍偷偷盗取工藤新一和柯南的指纹，新一的身份眼看被拆穿，巨大的危险正向他和身边的人急速袭来…
ps：影片于2009年4月18日在日本上映、2009年7月10日在中国台湾地区上映、2010年1月14日在中国大陆上映，是中国大陆地区引进的第一部柯南剧场版作品。
14.《天空的遇难船》
铃木园子的叔叔次郎吉不甘心失败，决定再次向怪盗基德发出挑战。这位坏脾气的大叔斥巨资制造了巨型的飞船贝尔·雪利二世号，并以镶嵌有名贵宝石"天空的贵妇人"的戒指作赌注，邀请基德前来挑战，看他能否在东京到大阪的这6小时时间内完成这项困难的任务。柯南、小兰等人理所当然也接到邀请，甚至电视台的人也兴师动众前来。随着时间的流逝，双方的对决悄悄展开。另一方面，恐怖组织红色暹罗猫也登上了飞船。此前不久，红色暹罗猫袭击了国立东京微生物研究所，并盗走一种致命的病毒。
ps：基德和小兰并没有真正吻到，小兰的初吻还是给的新一的.
15.《沉默的15分钟》
"针对你这4年傲慢无礼的执政期，在此施下天诛的警告！"一封谜一般的恐吓信突然寄到了朝仓都知事手中。次日在知事亲临剪彩现场的新地铁隧道中发生了爆炸！千钧一发之际，多亏了得知恐吓信之事的柯南，才避免了人员伤亡，但未能取知事性命的犯人恐怕不会就此罢手，而制造更大的灾难。柯南调查了这位朝仓知事的经历后，推测在其出任国土交通大臣期间建造水坝的相关者中有人仍怀恨在心，便从这方面入手开始搜查。
ps：这部剧场版算是柯南前15部剧场版中场面最火爆的。炸隧道、地铁在街上横冲直撞以及最后炸水坝，很有点好莱坞电影展现破坏力的味道。也是这一部剧场版以后，柯南电影里爆炸的场面多了起来。
