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后来，解放军进入湘西，整治当地土匪泛滥的情况，吕芪和杨武不但没有收敛，更是保持一贯作风，根本没把解放军放在眼里，不仅继续搜刮民脂民膏，更是时不时的带兵去扰乱解放军队伍，1949年10月1日新中国成立后，继续加大了剿匪的力度，并且特别围剿杨武这股土匪势力。

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杨武的侄孙杨齐是个聪明人，见杨武大势已去，于是就主动带着手下的人向解放军投诚，并且协助解放军开展剿匪行动，吕芪知道后非常愤怒，竟然绑架了杨齐以及和他一起投诚的人员家属，并残忍的将他们都给*害了，杨武也是对她百依百顺惯了，虽心生退意，却不敢跟吕芪反驳，只能跟着吕芪在大山里东躲西藏，一直到最后带着不多的残兵败将，狼狈不堪的躲进贵州边境的一处蝙蝠洞中。

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而洞外早已被解放军团团围住，他们也就无处可逃了，杨武这时候也鼓起勇气跟吕芪争辩了起来，认为他们大势已去，不如向解放军投降来保住自己的性命，但吕芪依旧固执己见，根本就不同意杨武的想法，甚至要求和杨武拿枪对峙，谁活下来就听谁的，杨武答应了，随后吕芪子弹上膛，毫不犹豫的开枪命中了杨武，可是杨武怎么舍得伤害自己的爱妻，所以并未对吕芪开枪，吕芪看着倒在血泊中的杨武，一时间悔意涌上心头，不打算继续反抗了，于是便丢了枪不做任何反抗。

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最后解放军将其逮捕，虽然杨武被吕芪击中，但是未伤及要害，杨武最后还是被抢救活了下来，经过一系列的审判，杨武被判为无期徒刑，而吕芪则因为作恶多端、心狠手辣，直接被判了死刑，1952年元月11日，吕芪被押至沅陵执行枪决，终年仅27。