喜马拉雅山脉的植被可以大体分为4带－热带、亚热带、温带及高山带－主要是根据海拔和雨量画分的。地方地形和气候以及光照和风吹的差别，造成每一带内植被构成的相当大的变化。热带常绿雨林局限于东喜马拉雅山脉和中喜马拉雅山脉潮湿的丘陵地带。常绿龙脑香科森林－一个可产木材和树脂的树群－是常见的；它们的异种生长在不同的土壤上和陡峭程度互异的山坡上。铁木可见于183～732米这一高度内可渗透的土壤上；竹子生长在陡峭的山坡上；栎树和栗生长在石质土上，覆盖了从中国藏南地区西部至尼泊尔中部，在1097～1737米高度的砂石。桤木可见于较陡的山坡水道沿线。在更高处，它们为山地森林所取代，林中典型的常绿树是一种露兜树。除了这些树外，估计约有4000种开花植物生长在东喜马拉雅山脉，其中20种是棕榈。

随着西向雨量的减少和高度的增加，雨林次于热带落叶森林，珍贵的木材树，娑罗双树成为主要树种；娑罗双树在海拔914米的高原及高达1372米的高原。再往西，草原森林、草原、亚热带棘草原及亚热带、半沙漠植被次第出现。温带森林从大约1372米延伸到大约3353米，包括针叶树和温带阔叶树。

东喜马拉雅山脉的动物主要源于华南和中南半岛地区：主要是可以在热带森林中找到的动物类型，其次才是那些适应了在较高海拔和较干西部地区的亚热带、山地和温带条件的动物类型。然而，西喜马拉雅山脉的动物却与地中海、衣索比亚和土库曼这些地区的动物有着较多的类同之处。一些非洲动物过去在这一地区的存在，例如长颈鹿与河马，可以从外喜马拉雅锡瓦利克山脉沉积层的化石遗迹推断出来。在树线以上高度的动物几乎完全由适应寒冷的当地特有物种构成，它们是在喜马拉雅山脉升高后从草原野生动物进化而来的。象、美洲野牛和犀局限于尼泊尔南部低矮山麓森林覆盖的达赖地区中的某些区域－－已被大体疏泄的湿地或沼泽地。印度犀牛在整个喜马拉雅山脉的丘陵地带曾经大量存在，但是滨临灭绝；麝和喀什米尔鹿也达到了灭绝的程度。喜马拉雅黑熊、云豹、长尾叶猴（一种亚洲长尾猴）和猫，是喜马拉雅山脉森林中其他恒生动物的一部分。喜马拉雅岩羚羊，例如塔尔羊，也可以见到。在树线以上更高的地方，雪豹、棕熊、赤熊猫（即小熊猫）和西藏牦牛偶能一见。牦牛已被驯化，在拉达克被用作役畜。然而，树线以上的典型栖息动物是多种类型的昆虫、蜘蛛和蟎，它们是能够生活在高达6309米之地的仅有动物种类。

喜马拉雅山脉矿物丰富，不过开发局限于较易进入的地区。查谟和喀什米尔是矿物最为集中的地区。在札斯卡尔山脉发现蓝宝石，在附近的印度河河床找到沙金。在伯尔蒂斯坦有铜矿床，在喀什米尔河谷找到铁矿。拉达克蕴藏着硼砂和硫磺矿。在查谟山找到了煤层。铝土矿也在查谟和喀什米尔出现。尼泊尔、不丹和锡金有着广布的煤炭、云母、石膏和石墨矿藏，以及铁、铜、铅、锌矿石。

喜马拉雅山邢脉的河流具有巨大的水力发电潜力，从20世纪50年代以来，在印度已经得到密集利用。一项浩大的多用途工程坐落在外喜马拉雅山脉的苏特莱杰河上的巴克拉-楠加尔，1963年竣工），水库蓄水能力约为100亿立方米，发电总装机容量为1050兆瓦。此外，戈西、根德格（纳拉亚尼）和贾尔达卡这3条喜马拉雅山脉河流也已经为印度所利用，向尼泊尔和不丹供电。

喜马拉雅山脉由19条主要河流排水，其中以印度河与布拉马普特拉河为最大，各拥有约259000平方千米的山地汇水面积。在其他河流中，有5条属于印度河水系－－杰赫勒姆河，杰纳布，拉维河，贝阿斯河，以及苏特莱杰河－－总汇水面积约为132090平方公里；9条属于恒河水系－－恒河、亚穆纳河、拉姆甘加河、卡利河（Kali，萨尔达河）、卡尔纳利河、拉普提河、根德格河、巴格马蒂河，以及戈西河－－疏泄另外217560平方公里汇水面积；还有3条河属于布拉马普特拉河水系－－蒂斯塔河、赖达克河，以及马纳斯河－－疏泄183890平方公里汇水面积。

雅鲁藏布江像一条银色的巨龙，从海拔5300米以上的喜玛拉雅山中段北坡冰雪山岭发源，自西向东奔流于号称“世界屋脊”的青藏高原南部，最后于巴昔卡附近流出国境，改称布拉马普特拉河，经印度、孟加拉国注入孟加拉湾。它在中国境内全长2057多公里，在中国名流大川中位居第五；流域面积240480平方千米，居中国第六，流出国境处的年径流量为1400亿立方米，次于长江、珠江，居中国第3位；天然水能蕴藏量达7911.6万千瓦，仅次于长江，居中国第二。河床一般高程在海拔3000米以上，是世界上最高的大河。