圆古特摄剧《奈克瑟斯奥特曼》的主角，背景:近年来世界各地不断有"异生兽"作乱的报告。为了暗中解决这个问题，成立了世界性的防卫组织TLT的下属特种部队夜袭队NR。他们的任务就是秘密消灭异生兽。异生兽突然出现在夜袭队面前，队员们陷入了苦战。这时，光之巨人奈克瑟斯奥特曼出现了。本作中奥特曼的人间体不叫作人间体，叫作适能者。奈克瑟斯一共有七个适能者，TV版五个，他的前身奈克斯特奥特曼一个，叫真木舜一，《艾克斯奥特曼》TV版一个，名为橘小百合。

​奈克瑟斯奥特曼出现时，他的适能者之一的姬矢准也出现了。奈克瑟斯利用相位的褶曲，制造出了"梅塔领域"。他将异生兽拉到这个空间内进行殴打。而且，夜袭队的特殊飞行器合体后也可以进入这个空间，与奈克瑟斯一起作战。

​夜袭队的新队员，孤门一辉与和仓队长以及其他的队员一起处理着繁忙的任务。可是他自从遇到姬矢准后对自己任务以及周围的环境产生了疑问。组织究竟隐藏着怎样的秘密？队员们的过去又是如何的？奈克瑟新和异生兽的原型到底是什么？在最后一集，孤门一辉在黑暗中拉出西条风，后来得到奈克瑟斯的力量和黑暗扎基战斗，最后变成了诺亚奥特曼，战胜了黑暗扎基。

1到24集是姬矢篇，25集进行一次转折，26到36集为千树篇，37集是最终集。