名为“学校”的4人组，其中的头领为学园都市最上位的5人排名第2的垣根帝督，能力为“未元物质”，发动能力后从背后伸展出未知的白翼，可以进行飞行、攻击，也可以用作防御，被认为是“不存在于这个世界上的物质”。

道具

4人都是妹子组成的组织，名为“道具”。由学园都市排名第4的超能力者麦野沉利作为头目，其能力为“原子崩坏”，通过对电子的控制，发射出粒机波形高速炮，其破坏力巨大，不过却很难控制，因此评价低于御坂美琴。

其他几位组织成员为绢旗最爱，泷壶理后，芙兰达·塞伊文，另外滨面仕上是她们的跑腿的。这个组织拥有多名LV4的能力者，加之首领的LV5，可以说实力颇具竞争力。而泷壶理后在特定条件下几乎可以拥有LV5的能力水平。

滨面仕上为无能力者，也是这部小说的主角之一，为Skill Out无能力者武装集团的首领，性格和当麻类似，不会对没有帮助的人坐视不管，为了自己喜欢的人能和LV5展开斗争的勇者。

其他组织

除了目前剧情中出现以上组织外，在原作的小说中还有其他的暗部组织登场，包括“区块”、“人员”、“学习”“食尸部队”和“新入生”，当然还有第二季中追*一方通行的“猎犬部队”。

布束砥信

被迫参与组织“学习”，成为组织的非正式一员，她是生物学精神医学领域崭的天才少女，参与“绝对能力者进化计划”，是“学习装置”的监修人。暗中干涉了计划。另外在“学习”的组织计划中，也对其进行了干涉，并且在御坂美琴的帮助下，拯救了菲布理和珍妮。

木原数多