肖博士感染异形病毒都大卫一手造成的，电影一开始就是肖博士和大卫一起进入工程师的飞船，他们不但发现墙壁上的符号文字，也发现了大量灌装黑水，然后大卫直接带走了一罐回去，他们两人开瓶解封了黑水，发现黑水是一种有机生命体，当时大卫给自己手指滴了一滴黑水带走，深夜和肖博士的丈夫一起喝酒，悄悄将手指那滴黑水滴入酒杯，于是肖博士的丈夫就感染了异形病毒。

随后肖博士又和丈夫发生关系，所以异形病毒就植入肖博士体内了，最终肖博士产下第一批多肉八爪体。其实这里大卫已经对人类有了反叛之心，然后他们赶往工程师母星的途中，大卫又将肖博士当宿主，培育出了经典版异形，可以说大卫真的很坏。

契约号在前往LV426星球的途中，飞船遇到太阳风暴，导致飞船失控，结果成批科学家因休眠仓着火被烧死。为什么会着火，这里其实是很合理的，首先休眠技术是一种速冻技术，而这种技术是一种很精密的操作，必须保证人体细胞的结合水不被破坏，而且解冻技术也是相当有难度的，目前在金鱼身体测试已经成功，所以休眠技术也是未来最有可能实现的技术。

以速冻的理论来看，休眠仓肯定有许多可燃物用作解冻燃料，当契约号遇到大规模震荡时，休眠仓系统作出应激处理去解冻，而外泄的燃料被引燃，所以船员被烧死。一般正常情况下，解冻应该是慢速加热的，而震荡却导致系统出现故障。