原版的故事中，被改造成假面骑士的青年南光太郎与妄图征服世界的远古怪人组织“戈尔戈姆”斗智斗勇。

最终，他击败了自己的宿敌“影月”秋月信彦，同时粉碎了怪人组织首领创世王的野心，解除了地球的危机。

而到了新作《黑日》里，故事则围绕怪人种族的存续以及社会问题展开。

重启版的世界中，怪人在日本社会中广泛存在，并且面临着严峻的歧视问题，只能在底层夹缝中求生。

而反派组织“戈尔戈姆”摇身一变成为政党，通过运动斗争为怪人争取权益，后来与日本当局勾结，逐渐暴露了自己的野心。