第二部讲述的是灵隐寺僧人道济济世救人、化解人间疾苦、管尽人间不平之事处处宣扬佛法、惩恶扬善，深得老百姓爱戴，被世人称作“活佛济公”，延续了《活佛济公1》故事人物，主要故事仍然围绕着济公带领广亮、必清、赵斌等人为老百姓排忧解难、点化世人展开穿插降龙尊者降魔除妖神话故事，以及济公活佛与地痞恶霸斗智斗勇生动故事。



第二部分为9个单元，《血魔出世》（1-5）；《贞节牌坊》（6-13）；《画中仙》（14-21）；《木马缘》（22-28）；《双退婚》（29-35）；《万应佛堂》（36-42）；《疯女劫》（43-48）；《雪女传说》（49-53）；《鬼郎君》（54-60）。

第三部依旧延续的第二部的故事，讲述的是济公他们同大鹏鹰和乾坤洞洞主等黑恶势力作战，带领广亮、赵斌等人为老百姓排忧解难、点化世人展开，穿插降龙尊者降魔除妖，以及济公活佛与地痞恶霸斗智斗勇。

第三部分为8个单元，分别为《天蚕变》（1-12）；《天鹅梦》（13-24）；《红花告御状》（25-36）；《人狐恋》（37-41）；《木偶奇谭》（42-50）；《恶狼传说》（51-59）；《朱罗记》（60-66）；《胭脂情》（67-75）。

距第一部播出已经有8年时间了，我们一直在等待的第四部，一直在等待的大结局却还没有回来，大鹏鸟还没有回归本位，乾坤洞洞主也还没有收服，白雪和赵斌的爱情也还没有交代……

之前也时不时有消息透露要拍第四部，但最后都不了了之，据说是投资方不满意第三部的收视率，所以才不拍的，而陈浩民主演的另一部剧《济公活佛》与这是没有关系的，两个不同的故事系统，那个不是《活佛济公》的续集。