中国公共卫生应急管理体系主要由突发急性传染病防治和突发事件紧急医学救援两个部分组成。中国全面的应急管理体系建设始于2003年非典事件。经过十多年的快速发展，中国公共卫生应急管理工作取得了长足的进步，各级政府卫生应急能力得到显著提升。2016年7月国家卫生计生委印发的《突发急性传染病防治“十三五”规划（2016～2020年）》（以下简称《规划》）成为中国突发急性传染病应急管理工作的新起点。

包括建设各方参与的公共卫生社会治理体系、集中统一的公共卫生应急指挥体系、专业现代的疾病预防控制体系、协同综合的公共卫生监测预警体系、平战结合的应急医疗救治体系。