根据《西游记》的描写，孙悟空在修炼自在极意功时，共开了三次。

第一次出现在《西游记》第四回《花果山水帘洞会东洋取经路》中，当孙悟空用心力将山呼吸法运用到极致，开启了自在极意功。

第二次出现在《西游记》第七回《天竺国灵土庙觐圣迎官第三封》中，当孙悟空于火焰山上与红孩儿战斗时，再次开启了自在极意功。

第三次出现在《西游记》第九十六回《孙行者智斗牛魔王　渔樵易服三入长老院》中，当孙悟空被牛魔王困在芭蕉扇里，他再次运用自在极意功摆脱困境。

这三次开启自在极意功都是为了应对强大的对手或危险情况，并展现了孙悟空无比强大的武学修为和变化之术。

在跟吉连战斗时，开了两次