首先，这幅名画中处处遵循着黄金比例法则，这个比例被认为是最能让人产生愉悦感的比例，再加上达芬奇运用极高的绘画技巧，让观赏者的眼睛和大脑对画中的光暗对比形成了不同的反应。

这也就解释了为什么从任何的角度看《蒙娜丽莎》，画中的女子都在微笑。并且，曾有研究人员利用微表情理论发现，蒙娜丽莎的微笑中，含有83%的高兴、9%的厌恶、6%的恐惧、2%的愤怒。

其次，《蒙娜丽莎》中的背景图也不简单。有专家研究发现，画中女子的背后隐藏着四种奇怪的动物，看起来像是人猿、狮子、水牛与巨蛇。还有人将《蒙娜丽莎》镜像拼接后，竟然发现了一个外星人的面孔，外星人的脸部轮廓十分明显，还戴着帽子和披肩，就像个外星祭祀。

而镜像可以说是达芬奇的一个特色，人们曾在他去世后留下的大批手稿中发现，很多手稿都是达芬奇用独特的左手镜像反写字书写，内容神秘。将这两者结合来看，是否就意味着达芬奇在《蒙娜丽莎》中曾暗示人类外星人的存在?

最后，众所周知，达芬奇是人类历史上绝无仅有的全才。他不仅在绘画上有着极高的成就，在数学、生物学、物理学、天文学等方面也都有着远超常人的见解。爱因斯坦曾表示，如果达芬奇的科研成果在当时发表，可以让人类的科技提前三十至五十年。

此外，达芬奇在密码上也很有研究，他经常使用各种密码以及符号来传达信息。而《蒙娜丽莎》中女子的右眼球上画有黑色的LV字样，左眼球上有着看起来像CE或B、S的字符，在背景中的桥拱上也可以看到类似数字72的模样。而这些字符究竟代表着什么？是否是达芬奇在向人类传达某些信息？目前虽然有着种种猜测，但是事实究竟如何犹未可知。