亚青寺是以河为界分为扎巴、觉姆两区，一共八个州。：法性光明洲、轮涅法性洲、普贤静虑洲、大乐解脱道洲、明体自解脱洲；觉姆区分为三个州：乐空双运洲、普贤大乐洲及二谛双运洲。亚青寺的僧侣每年百日闭关，也是这里非常重要的一项功课，她们日复一日的转经、上课，年复一年的闭关祈祷。

亚青寺每日开放时间为早上7:00—下午18:00，没有门票，可以随意进出。亚青寺在修学方面和色达佛学院地位差不多一样，在亚青寺内常年都有两万多名全国各地前来进修佛学的僧侣居住在这里完成学业，同时亚青寺也是藏族红教的一处圣地，因此在前往亚青寺游玩，一定要尊重当地习俗，未经僧人同意请勿随意给僧人拍照。