珠杰曾因忆念宗喀巴大师深恩，涕泣伤感，毛骨颤悚，因此至诚祈祷大师说:“具足三恩德无与能等之上师啊!祈祷慈悲加持我，亦请慈悲观照末法中忧苦的众生吧!如今大师之教法，有如空中之闪电，亦如海市蜃楼般地即将隐没，我于何时能到上师之足前呢?”克珠杰祈祷完毕，见宗喀巴大师骑着一只猛虎，瞬间出现于对面虚空中。大师全身赤红色，眼如铜铃，鼻槽丰大，现金刚瑜伽师相。右手执利剑，上扬于虚空中，火焰炽燃。左手拿着嘎巴拉，置于胸前。嘎巴拉里面，盛满甘露。头发赤红色，青绸缠缚着。身上挂满人骨，作为庄严。脸上露出极欢喜的笑容。身旁有84位大成就者前后围绕着。此时，大师安慰克珠杰说:“儿啊，你不要过于悲伤，我除您以外，再也没有别的可想了。就像你除我以外，又能想谁呢？我并没有放下你到别的地方，以后你如果想念我，可详阅《菩提道次第广论》和《密宗道次第广论》以及其他一切著作。这些都是我的遗教，你看这些论著就等于看到我一样。目前众生的福德非常微薄，烦恼极粗猛，圣教即将面临隐没了，你现在可发愿到此空行世界来。”

又有一次，克珠杰心想，我希望后世能往生大师座前，因此现在应祈请大师降临，请问他现在住的地方和一些尚待抉疑的问题。于是陈设极上妙供和一座纯金的曼陀罗供，并至诚祈祷说:“敬礼父师三世佛，众生唯一皈依处，结尊文殊无能胜，祈请慈悲降临此。”此时，宗喀巴大师坐在白云上端的金刚座上，现身于对面虚空中。大师仍作生前之相，双手作双转法轮印，左右各持一支乌巴拉花。右边花上置利剑，左边花上置梵箧和智慧镜。他告诉克珠杰说:“儿子啊!你应准备好一切，赶快到我这边来，我会派人去迎接你的。”克珠杰问大师说:“请问上师，您现在到底住在哪里?”大师回答说:“我的化身遍一切处，有的在空行世界，有的在都史陀天，有的在南瞻部洲。如今我在中国五台山的化身，每天为1800位金刚比丘上午宣讲《中观》、《菩提道次第广论》和《密宗道次第广论》，下午讲释《集密金刚》、《胜乐金刚》和《大威德金刚》等三部密法。你应该发愿到这里来，不久你我师徒即可相会了。”