当时北部加利福尼亚人选择与美军并肩作战，而南部加利福尼亚人却抵制了美国的戒严令。1847年美军将领史蒂芬·卡尼击败南部加利福尼亚抵抗军。1848年墨西哥在《瓜达卢佩伊达尔戈条约》中正式将加利福尼亚割让给美国。由此可见加州在并入美国之前事实已脱离墨西哥的管辖处于一种独立状态。加州人对是否加入美国从一开始就存在不同意见：有的加州人是自愿加入美国，有的加州人则认为是美国吞并了加州。

美国是依据1787年宪法由各州组成的联邦制国家。从美国诞生的第一天起联邦与州的关系问题就是长期争论不休的话题：主张强化联邦权力的政治派别强调联邦不仅是各州的集合体，也是直接受托于人民，因此联邦的权力来自于人民的授权，而非各州之间的契约。与此同时强调州权的政治派别则认为联邦只是各州之间缔结的契约，所以各州可以自由选择去留。在美国一个州究竟是否有权力脱离联邦就此成为一笔说不清道不明的糊涂账。

正是这笔糊涂账诱发了美国历史上的南北内战。这场战争在本质上就是由于南方各州不想跟着联邦混了、想独立出去而引发的。美国宪法既没明确说各州有选择独立的权利，也没明确禁止各州脱离联邦而独立，但南北战争已充分表明了联邦政府在这件事上的态度。南北战争结束后吸取了教训的联邦政府就通过宪法修正案加强了对各州的控制力。1869年又发生了德克萨斯州想争取独立的“德克萨斯诉怀特案”。

美国联邦法院对此案的裁定是：当德克萨斯成为美国之一员时就进入了一种不可分割的关系——这其中就包括永久联盟的义务。如今的美国宪法规定：一个州要独立首先必须取得本州绝大多数民众的支持，然后还要取得其他各州2/3的代表同意才能够通过独立修正案。即使在该修正案被通过后还将会被送去给50个州的立法机构并至少得到38个州的同意才能被采纳。采纳后的独立修正案还需要经过国会参众两院的批准。