这要从广州的地理位置说起，广州是世界海上史上唯一两千多年长盛不衰的大道，海上丝绸沿线的商人云集广州已经两千多年，一直经久不衰。作为海上丝绸之路的国家，广州是海上丝绸之路中国与其他国家海上贸易的重要通道，也使得其他国家文化在此传播，地处广州的光孝寺也成为佛教文化传播的前沿阵地。1650年清军南下，炮轰广州城，光孝寺也笼罩于战火之中。清军入城后，光孝寺被占为兵营，隔年又由于广东贡院在清军入城时毁于战火，故把光孝寺作为贡院。期间，光孝寺进行过修建。

如今的千年古寺每天人们来来往往的点燃香火寄托心愿。