我们可以在TV版第21话“NERV、诞生”中找到答案。

首先简单介绍一下故事背景，2000年，SEELE在南极的地下空间中找到了亚当，并派出葛城调查队前去对其进行调查，在实验中不慎引发了“第二次冲击”，亚当本体也以“光之巨人”的形象第一次在动画中现身。第二次冲击绝非偶然，事发的前一天，碇源渡带着全部的研究资料回到了日本，这也成为了日后制造EVA的重要参考。

2003年左右，“亚当再生计划”又称“E计划”正式开始进行，通过克隆等各项技术，以亚当为蓝本，制造了第一台EVA，也就是零号机。之后又用类似的手段，复制了二到四号。初号机比较特殊，是莉莉丝的复制，并最终成为了补完计划的一环。

所以说用“克隆”比“制造”更为贴切。当然，后续要搭载很多设备，才能算是完成制造，例如插入栓，通信设备，限制器，内脏电池，外置盔甲等等。

当然EVA只是躯壳，想让它动起来需要有灵魂的支持。

所以才有了驾驶员的同步技术。EVA的核心是灵魂人的容器，插入栓插得越深，人的灵魂就距离核心越近，同步率就越高。剧场版破中的真希波玛丽在开启了二号机的兽化模式后，插入栓深度直接变成负值，也就是已经插到核心里面去了，所以同步率暴涨。

另外，大家都知道，唯在初号机的启动实验中，与核心直接接触，与初号机融为一体。当碇真嗣与初号机失去同步的时候，碇唯的灵魂会站在主导地位驱动EVA，也就是我们常说的暴走。