其一，反清复明，延续正统。

南明形式图

当时，南明永历帝已被吴三桂绞死在昆明十字坡。作为赐予国姓的朱成功，为其政权的正统合法性，不仅沿用永历年号，还会继续高举反清复明的旗帜，正如三国诸葛亮所说的：“汉贼不两立，王业不偏安”。

然而，郑成功当时面临的绝境境几乎与诸葛亮如出一辙，甚至形势更加危急。

首先，南明灭亡后，天下大势日趋于太平，百姓皆希望安居乐业，百废开始俱兴。同时，清朝开始轻徭薄赋，重办科举，越来越多的士大夫与平民开始认可清朝，统治根基越来越牢固。

錢謙益應招

其次，南京之役后，郑军元气大伤，不得不重新退回金厦二岛养精蓄锐。两岛弹丸之地尚不足以支撑数万残兵败将，又谈何驱除鞑虏，恢复中华？所以为解决最直接的生存问题，郑成功才决定挥师收复台湾。

然而，主力移师台湾就意味着失去金门厦门这两个在大陆的重要据点。事实证明亦是如此，两年后，荷兰殖民者与清朝组成联军，共同攻击两岛，郑成功之子郑经寡不敌众，在大陆的最后的军队也被迫撤往台湾。

所以得了台湾作为后方基地，但同时失去两岛作为大陆据点，这就等于既进了保险箱，也进了死胡同。这也决定郑氏再想与清朝逐鹿中原，再造汉人江山便无可能。

清荷联军

虽然中原得鹿不由人，但郑成功作为民族英雄其精神，确万古长存。大清康熙帝虽作为郑成功的敌人，却给予了非常高的评价：“四镇多二心，两岛屯师，敢向东南争半壁；诸王无寸土，一隅抗志，方知海外有孤忠。”

其二，称霸东亚，保护华人。

虽然，大清国运蒸蒸日上，反清复明逐渐心有余而力不足，但郑氏在东亚、东南亚的海上霸权却是毋庸置疑的。早在郑芝龙时代，东南沿海的来往商船就争相悬挂郑旗，以确保不会被猖獗的海盗所窥伺。