混沌初开，天地伊始。大道上行而为云，大道下降而为雨，天地间淸升浊降。

地球上的水、二氧化碳、甲烷和氮等简单的化合物经过亿万年时间的互相作用最终出现了嘌呤和嘧啶的有机物质，它们是组成遗传分子脱氧核糖核酸的构件，即DNA。在“原始汤”里，又经过漫长的时间，一个非凡的分子偶然形成-复制因子。一个有机物可以吸取周边的物质来复制自己，想象一下，这是多么神奇的事情。

基因(遗传因子)是具有遗传效应的DNA片段。基因支持着生命的基本构造和性能。储存着生命的种族、血型、孕育、生长、凋亡过程的全部信息。环境和遗传的互相依赖，演绎着生命的繁衍、细胞分裂和蛋白质合成等重要生理过程。生物体的生、长、衰、病、老、死等一切生命现象都与基因有关。它也是决定生命健康的内在因素。因此，基因具有双重属性:物质性(存在方式)和信息性(根本属性)。

基因有两个特点，一是能忠实地复制自己，以保持生物的基本特征；二是基因能够“突变”，突变绝大多数会导致疾病，另外的一小部分是非致病突变。非致病突变给自然选择带来了原始材料，使生物可以在自然选择中被选择出最适合自然的个体。

随着第一个复制因子出现，“原始汤”（即原始海洋）中出现了它的拷贝，拷贝逐渐增多，并且呈几何级速度地扩散开来，很快就布满了整个原始海洋。但随着拷贝的增多，错误出现了。这是因为复制基因吸收的周围的营养物质并非都是稳定的，随着复制数量的增多，它同样吸收了很多原始汤里并不稳定的特殊类型分子，于是变异产生了。就像圣经、佛经的誊写员，即便每一代誊写员都认真精确的进行誊写任务，日复一日的拷贝过程中也难免会出现错漏。《红楼梦》问世至今200余年，但传世的手抄本就有50多个版本，其中每一章节都有字数和文字的差别。

随着错误的产生和扩散，原始汤里出现了很多不同种类的复制分子组成的种群，他们之间各有不同，但都源于一个祖先。这些分子之间也互相吸收、排斥或者共生，逐渐形成更大的组团。组团中各个细胞分子按照长久以来不同的习惯倾向，形成了负责吸收、维持生存、和生殖繁衍的各个功能，于是真正意义上的生物产生了。

基因是控制生物的程序，生物是基因的生存机器。生存机器最初是作为基因的贮存器存在的，它们仅仅是为了保护细胞壁里的基因和其它细胞免受敌手的攻击。在远古时代，原始汤里大量的有机分子是它们的食物，这些有机食物千万年来在阳光有力的影响下孳生繁殖，但随着这些食物的告罄，生存机器逍遥的生活就结束了。这时，一部分生存机器开始自己利用阳光把简单分子组建成复杂分子，并以快得多的速度重新在原始汤里进行合成作用，它们被叫做植物。稍后，另一支生存机器发现了可以通过吞噬植物光合作用后取得的劳动成果的生存方式，它们被称为动物。动物们为了生存而追逐植物群落，通过食用植物或其它动物而生存。这两大类生物都在时间的长河里锤炼出日益巧妙的生存技巧，随着生存竞争的不断升级，在共有的体内存在一个中央协调的系统（大脑）必然比无政府状态有利得多，于是高级生物出现了。基因把它们造得越来越大，这样就可以避免被其它动物吞食，从而增加了生存的概率；由于海洋生存空间的狭小，基因又让它们爬上了陆地、飞上了天空，把基因传播得更远更广。