光绪二十八年（1902年）塔吉克族聚居的色勒库尔地区设蒲犁分防厅（隶属于莎车府）。民国二年（1913年）在当地设置蒲犁县（属喀什噶尔道）。中华人民共和国成立后于1950年3月在当地成立蒲犁县人民政府。1954年9月17日蒲犁县改为塔什库尔干塔吉克自治县。塔什库尔干塔吉克自治县东南和东部与叶城、莎车县相连，西北、西南和南方三个方向分别与塔吉克斯坦、阿富汗、巴基斯坦三国接壤。

塔什库尔干塔吉克自治县属于高海拔地区：世界第二高峰——海拔8611米的乔戈里峰就坐落于其境内。地处边境的塔什库尔干塔吉克自治县是以塔吉克为主体的多民族聚居地区：当地除塔吉克族之外还生活有柯尔克孜、维吾尔、汉、回等13个民族。当年汉朝公主避难产子的公主堡如今就坐落在塔什库尔干城南60公里处的塔格敦巴什帕米尔山上。塔什库尔干塔吉克自治县也是电影《冰山上的来客》故事发生地。