清理鱼缸的工具鱼种类有很多。最常见的是清道夫，这种鱼生活在水体下层，可以吸食落在缸底的残饵和污物。除此之外，其它的工具鱼大多只能吃藻类，比如青苔鼠、黑线飞狐以及小精灵鱼等。其中青苔鼠只在幼鱼时期吃青苔，黑线飞狐主要吃须状藻和丝藻，小精灵鱼还可以吃蜗牛卵。
清道夫是常见的工具鱼，也是清理效果最好的。这种鱼本身生活在水体的底层，嘴也长在下部，方便它吸食水底的残饵和污物，从而能够避免水质的恶化。需要注意的是，清道夫只能在短期内改善水质，因为它本身也会排泄。
二、青苔鼠青苔鼠是一种食藻鱼，它虽然不能像清道夫一样将水底的有机物吃掉，但对于除藻确实一把好手。不过这种鱼只在幼鱼时期会以青苔为食，成鱼就不吃了，而且还容易舔其它鱼的鱼鳞，从而导致其受伤等，一定要及时捞出。
三、黑线飞狐黑线飞狐也是比较常见的食藻鱼之一，它主要吃的是须状藻和丝藻。需要注意的是，这种鱼不仅可以吃藻，也能吃其它的鱼饲料，不过最好不要喂的太多，不然它的胃口会变叼，导致它不吃藻类。
四、小精灵鱼小精灵鱼也是一种工具鱼，它可以吃苔藻，同时还能消灭水中的蜗牛卵，控制蜗牛的数量。值得一提的是，这种鱼主要以藻类为食，所以当水中没有藻类的时候，它很容易因缺乏食物而导致死亡。
