将鱼肠放好之后在上面覆上一层土盖实，如果鱼肠是放在容器中的就将它们放在阳台上，在土上加一些水，可以加快发酵速度，然后将容器封存好，放在阳光比较充足的地方发酵。在土里埋着的就不用搭理它了，让它自行发酵。

大概3到6个月，可以发酵成肥土，发酵时间的长短跟温度有关，温度高的时候会发酵的快一些。发酵后的废土用来种菜种花都是可以的。也可以直接在埋上鱼肠的肥土上直接种菜或者是种花。在刚埋下的鱼肠上面直接种也是可以的，但覆土的厚度要厚一些，最好在10厘米以上，防止鱼肠发酵时烧坏植物根部。

收集鱼肠最好在冬季，如果在其它季节收集鱼肠，最好要新鲜的鱼肠，被苍蝇爬过叮过的鱼肠不要用，否则土里会有很多蛆。

在处理鱼肠时，会有很强烈的腥臭味，在处理过程中，最好戴上手套口罩，温柔小心的处理，太暴力的话，有可能会将鱼肠溅到衣服上面，会弄得一身都是腥臭味，感觉洗澡都很难洗掉。