01 氯*菌
氯的效率取决于氯的浓度，接触时间和水的pH值。
它常用在对饮用水进行灭菌消毒上，一般余氯浓度为0.5ppm。
在工业水处理中，通过维持水中余氯浓度0.5-1.0ppm以上就可预防热交换器和砂滤器上的微生物污染，氯加药量取决于进水中有机物的含量，因为有机物会耗氯。
地表水处理通常需要在反渗透预处理部分采用氯消毒以防止微生物的污染，方法是在取水口加氯，并维持20-30min的反应时间，让整个预处理管线内保持0.5-1.0ppm余氯浓度。
但在进入膜元件之前必须经过彻底地脱氯处理，防止膜受到氯的氧化破坏。
(1) 氯化反应
常用的含氯消毒剂为氯气、次氯酸钠或次氯酸钙。在水中，它们迅速水解成次氯酸。
Cl2 H2O → HClO HCl (1)
NaClO H2O → HClO NaOH (2)
Ca(ClO)2 2H2O → 2HClO Ca(OH)2 (3)
次氯酸在水中会分解氢离子和次氯酸根离子：
HClO←→ H ClO- (4)
Cl2、NaClO、Ca(ClO)2、HClO 和ClO–的总和称为自由氯（FAC）或残留余氯（FRC），并以mg/LCl2计。
氯与水中氨类物质反应将形成氯胺，这类氯胺化合物被称为结合氯（CAC）或结合余氯（CRC），余氯和结合氯的总和称为总残留氯（TRC）。
TRC = FAC CAC = FRC CRC (5)
余氯的*菌效率与未分解的HClO的浓度成正比，次氯酸比次氯酸根的*菌效力要高100倍，未解离次氯酸的比例随pH 值的降低而增加。
在pH=7.5（25℃，TDS=40mg/L）时，仅有50%的余氯以HClO存在，但在pH=6.5时，90%为HClO。
HClO的比例也随温度的降低而增加，在5℃时，HClO的分子分数是62%（pH=7.5，TDS=40mg/L），在高含盐量的水中，HClO的比例很少（当pH=7.5，25℃，40000mg/L TDS时，比例为30%左右）。
(2) 氯的投加量
加入的一部分氯与水中氨氮发生反应，按下列反应步骤形成结合氯：
HClO NH3 ←→NH2Cl(一氯胺) H2O (6)
HClO NH2Cl ←→ NHCl2(二氯胺) H2O (7)
HClO NHCl2 ←→ NCl3(三氯胺) H2O (8)
上述反应主要取决于pH 和氯/氮的质量比，氯胺也有*菌作用，但是要低于氯的效果。
另一部分的氯气转变成非活性氯，这部分的需氯量取决于还原剂如亚硝酸盐、氯化物、硫化物、二价铁和锰等，水中有机物的氧化反应也要耗氯。
(3) 海水加氯处理
与苦咸水中的情况不同，通常海水中含有65mg/L左右的溴，当海水进行氯的化学处理时，溴会与次氯酸快速反应生产次溴酸
Br- HClO → HBrO Cl- (9)
这样对海水进行氯的处理时，起*菌作用的主要是HBrO而不是HClO，次溴酸会分解成次溴酸根离子。
HBrO ←→ BrO- H (10)
HBrO的分解程度比HClO的分解程度低，在pH=8时，仅有28%的HClO不会分解，但却有83%的HBrO是不会分解的。
针对海水在高pH条件下，仍比在苦咸水时的*菌效果好，次溴酸和次溴酸根离子会干扰余氯的侧定，包含在余氯测量值内。
02 冲击式*菌处理
冲击处理方式是在有限的时间段内以及水处理系统正常操作期间，向反渗透或纳滤的进水中加入*菌剂。
亚硫酸氢钠常常被用于这种处理目的，有一般情况下，500-1000ppm的NaHSO3加入30min左右即可。
冲击处理可以按固定的时间间隔周期性地进行，例如每隔24h一次，或怀疑出现生物滋生时处理一次。
在这种冲击处理期间所产的产水会含有所加入的亚硫酸氢钠浓度的1-4%。
根据产水的用途，可以决定是否应将冲击*菌期间的产水回收还是排放掉，亚硫酸氢钠对需氧的细菌比对厌氧的微生物更有效。
因此，采用冲击*菌处理应事先经过仔细评估。
03 周期性消毒
除了连续地向原水加入*菌剂外，也可以定期对系统消毒以控制生物污染。
这种处理方法用于存在中等生物污染危害的系统上，但在有高度生物污染危害的系统，消毒仅是进行连续*菌剂处理的辅助方法。
进行预防性的消毒比进行纠正性*菌更为有效，因为孤立附着的细菌比厚实、老化的生物膜要容易被*死和清除掉。
一般的消毒间隔是每月一次，但有严格卫生要求的系统（如制药工艺用水）和高污染原水（例如废水）也许会每天一次，当然膜的寿命受到所用化学品种类、浓度的影响，经过强烈的消毒，可能会缩短膜寿命。
04 臭氧*菌
比氯的氧化性更强，但它能快速分解，因此，需要维持一定量的水平才能*灭微生物，同时还要考虑所用设备的耐臭氧能力，通常应选用不锈钢。
为了保护膜元件，必须仔细认真地脱除臭氧，紫外照射可以成功地达到这一目标。
05 紫外照射
254 纳米的紫外光被证明有*菌作用，它已经在小型水厂得到应用，它不需要向水中加入化学品，设备维护要求低，仅需定期的清洗或更换水银蒸汽灯管。
但紫外照射处理的适用情况非常有限，仅适用于较干净的水源，因为胶体和有机物会影响光辐射的穿透。
06 亚硫酸氢钠
当其浓度在海水淡化系统的进水中达到50mg/L时，控制生物污染就有效果。通过这种方法，还可以减少胶体污染。
由于亚硫酸的酸性反应生成氢离子，因而无需加酸控制碳酸钙，这是亚硫酸的一个额外优点。
HSO3- → H SO42-
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