1、因地制宜地选用适合当地栽培的抗根腐病的品种，春小麦可选用龙麦23号、龙辐麦7号。冬小麦可选用西农881、秦麦2号、12号，西农1376等抗根腐病品种。种植不带黑胚的种子。2、提倡施用酵素菌沤制的堆肥或腐熟的有机肥。麦收后及时耕翻灭茬，使病残组织当年腐烂，以减少下年初侵染源。3、采用小麦与豆科、马铃薯、油菜等轮作方式进行换茬，适时早播，浅播，土壤过湿的要散墒后播种，土壤过干则应采取镇压保墒等农业措施减轻受害。