乱世之中曾经佛法昌盛的青藏高原万佛齐喑，僧侣们以佛法之名行淫欲*戮、败坏佛教名誉，五世达赖喇嘛在评价这段历史时写道：“（僧侣）持械*人，恣意酒肉，纵情淫乐。论师们各从所好，自立宗规”。同时期的苯教却蒸蒸日上。

与此同时，作为佛教发源地的印度，大部分佛教寺庙都也已经改宗印度教，远道而来的伊斯兰教则势头迅猛，青藏高原以北中国新疆境内的诸佛国，也大部分被伊斯兰势力攻灭。佛教正受到内外南北各方的夹击，极有可能在印度、西藏同时灭亡。这样不但青藏高原上佛教消失，也不会有后续藏传佛教在蒙古高原的传播，今日中国的宗教格局将发生天翻地覆的变化。

在朗达玛灭佛、天下大乱之时，偏远的冈仁波齐反而成了虔诚佛教徒的避难所，一支崇信佛教的吐蕃王室后裔，吉德尼玛衮王子，带着千余骑士来到冈仁波齐脚下的普兰县境内，之后逐步扩展到阿里全境，建立了西藏历史上著名的古格王国。

古格王室力图复兴佛教，西藏、印度各地佛教僧侣纷纷前来，其中最著名的是印度佛学中心超戒寺的住持燃灯阿底峡尊者，是藏传佛教史上影响最大的印度高僧之一，他的到来让衰败的佛教开始在冈仁波齐周边重兴。可以说，是冈仁波齐这个地方成了佛教最后的避难所，保留了佛教的火种。