建筑工程施工二级资质，如果是该类别的最低等级资质，就和其他建筑资质的办理流程一样，直接申报办理，具体分析如下：

1、申请人向省建设厅提出申请，提交有关材料。其中，中央管理的企业直接向建设部申请;

2、省建设厅对建筑业企业申请施工总承包特级、一级和专业承包一级资质的申请材料进行初审;其中涉及交通、水利、通信、电子等方面资质的，由省建设厅商讨同级有关部门审核同意后，提出初审意见，并将初审意见和全部申请材料上报建设部;

3、省建设厅对建筑业企业申请二级及以下资质(包括不分等级资质)和劳务分包资质的申请材料进行审查;其中涉及交通、水利、通信、电子等方面资质的，由省建设厅征得同级有关部门初审同意后进行审核;

4、准予许可的，于法定时间内(20个工作日)向申请人颁发、送达资质证书。

建筑工程施工二级资质，如果不是该类别的最低等级资质，那么办理方式就有许多，包括了升级、收购和代办。其中，建筑工程施工二级资质的升级流程如下：

1、满足资质升级条件，准备企业符合要求的材料

2、材料准备充分后，到所属地区的建筑主管部门申请

3、建筑部门对材料进行审批，审核企业的资格

4、经主管部门审核合格，颁发相应资质证书

需要注意的是，在资质升级办理中，企业办理三级升二级资质的，需经过所在地的省级建筑部门审核;办理总承包资质二级升一级的，企业还需要报建设部审批。