唐代，胡逗洲得到开发。僖宗乾符二年（875），南通已有狼山镇遏使的职位。后来，五代吴国曾设丰乐镇、大安镇、崇明镇及狼山镇。五代时直接统治静海与东洲一带的是姚氏家族。姚彦洪建筑城池官廨，号称"静海都镇"，统辖狼山、丰乐、大安、崇明四个大镇。

后周显德三年（956），周军压境，姚氏政权控制东洲、静海约半个世纪的局面结束。显德五年（958）初，后周设立静海军，不久升静海军为通州（今南通市），并设静海、海门两县归通州管辖，州治驻静海。通州，按其位置来看，由海路北上可达齐燕辽东，南下可抵闽越，沿江南可至三吴，西可到楚蜀。四方通达，因以为名。通州宋代属淮南东路，天圣元年（1023）通州改名为崇州，又称崇川。政和七年（1117）通州一度称静海郡。元初至元十五～二十年（1278～1283），通州曾升为通州路，二十一年恢复为州，属扬州路。崇明县曾短时间归属通州，后又划属苏州。明初，静海县废，此后，通州只管辖海门一个县。清康熙十一年（1672）海门县废，通州无属县，至雍正二年（1724），通州升为直隶州，划如皋、泰兴二县归通州管辖，这种隶属关系一直维持到清统治结束。

乾隆三十三年（1768）设立海门直隶厅，直属江苏省管辖。1912年，民国政府废州厅设县，江苏通州改称南通县，海门厅改称海门县；1928年，设启东县。抗日战争期间，新四军建立苏中根据地，今南通范围内曾为苏中四行政区辖地，民主政府建立县级政权。1941年初，设立如西县，1943年在海泰地区设紫石县。抗战胜利后，南通范围内曾为苏皖第九行政区及一行政区的一部分。1945年，改如西为如皋县，改如皋为如东县。1948年改紫石县为海安县。1949年南通城解放，南通县设市，驻南通城，南通市曾为苏北行署辖市，后又为江苏省辖市。南通设市后，于金沙镇另设南通县。南通范围内的六县属南通专员公署管辖。1983年3月，实行市管县体制，南通市管辖六县二区的格局形成。1990年前后，启东、南通、如皋、海门四县分别撤县建（县级）市，其中，南通县改称通州市，六县(市)仍属南通市管辖。