故事结尾，科学家们发现一场外星瘟疫能使变形金刚在战斗中自我残*。这无疑会导致汽车人和霸天虎的共同灭亡。现在只有一个人可以救大家。那就是已经死去了的擎天柱。

瘟疫很快就传遍了整个地球，许多机器人和人类都被感染上了。但是还有一小部分汽车人、霸天虎和五面怪暂时没受感染。

他们一起合作使已经死去了的汽车人领袖擎天柱复活。

复活后的擎天柱马上投入到与死神的搏斗中，后来和惊破天合作，最后打开能源宝救活了所有染毒的变形金刚之后惊破天对擎天柱表示钦佩，并说以后不再有战争。

随后启动了巨型基地——撒克巨人，巨无霸基地在人类斯派克指挥下也赶赴战场，霸天虎和撒克巨人战败逃往宇宙深处…（剧终）