新一轮党政机构改革中，省市县党政机构，都有限额设置。省级党政机构不超过60个，省会城市55个，大城市50个，中等城市47个，县级市、小城市、大县37个，中县35个，小县33个。市县基层党政部门不要求与上级政府部门一一对应，可以多对一。而且市县不允许设立部门管理机关和“事业局”，因此，一些不能单独设立、职责较为重要的机构，就只能采取挂牌、内设、合署办公，甚至整合、合并的方式，将其承担的职能由职能相近的部门承担。
例如，承担行政职能较多的畜牧兽医局，可以在农业农村局挂牌，也可以内设，也可以合署办公，也可以直接整合到农业农村局机关。虽然都是由农业农村局机关承担原畜牧兽医局职责，却又分为不同的设置方式，其区别如下：
1、挂牌机构、合署办公：挂牌机构，是指两个同性质的机构整合在一起，实行一套人马、两块牌子的管理方式，挂牌机构的职能由主体机构完全承担，可以在机关内设相关科室，也可以完全整合到主体职能之中。保留牌子的目的，是可以保留牌子和印章，保持对上、对外联系，方便专业职能发挥。合署办公和挂牌机构类似，原来合署办公机构和挂牌机构的唯一区别，是可以多设置一个专职领导，如今已经没有了这个特权，合署办公和挂牌一样，已经不被单独提起了。
2、内设机构：内设机构也是同性质机构整合的一种方式，和挂牌机构的区别，除了不再保留原单位的牌子外，内设机构级别规格原则上低于主体机构，例如市级农业农村局为正处级，畜牧兽医如果设置为农业农村局的内设机构，只能为正科级；县级农业农村局为正科级，内设机构只能为股级。县级内设机构一般不保留单独对外的权利，也不保留印章。
3、合并：合并则是将职能完全整合到局机关，不仅不保留牌子，也不保留单独对外的权利和印章。
机构整合，只能整合机构性质相同的机构。畜牧兽医局整合到农业农村局，不管是彻底合并，还是挂牌、内设，都是剥离出畜牧兽医局的行政职能进行整合，而不是行政、事业职能混杂整合。畜牧兽医局剥离出来的行政执法职能整合到农业农村执法中心，公益服务职能整合到农业农村局下属事业单位。
其他机构类似，例如机要、保密、档案局在党委办公室挂牌，规划局整合到自然资源局，文化、旅游、体育、广电整合成立体育和文化旅游广电部门，都是行政部门之间，或者是以行政部门为主、整合事业单位的行政职能，不同的整合方式。
