佐助的查克拉属性有雷和火两种，其中雷属性的代表忍术是千鸟，火属性的代表忍术是豪火球。不过后期的佐助直接开挂轮回眼，他的查克拉属性也有两种直接升级到多种。

一，雷属性：所谓的雷属性是忍者的查课拉性质，根据性质的不同可以使用不同的忍术，如佐助在雷属性的作用下可以使用千鸟，它是雷属性的查克拉进行形态变化和性质变化的产物（类似于鸣人的螺旋丸手里剑），具有很强的贯穿力，特别是对土遁忍术非常有效。不过佐助最强的雷属性忍术不是千鸟和千鸟流，而是集结九大尾兽查克拉的因陀罗之箭。

二，火属性：火属性是佐助最基本的查克拉属性，它是宇智波一族生来就具有的查克拉的属性，在它的帮助下佐助可以使用豪火球之术等，不过佐助好像对火属性的查克拉不怎么青睐，以至于火遁忍术他不怎常用。其实佐助的天照并不是火遁，它是万花筒写轮眼的能力之一，只能通过写轮眼进行释放和熄灭。

三，后期的佐助在六道仙人的帮助下开启了轮回眼，以至于他的查克拉属性已经不是单纯的雷和火。要知道轮回眼是一种非常特别的眼睛，它起源于十尾（查克拉始祖），具有阴阳，风，火，雷，土，水多种属性的查克拉，可以使用以上多种属性的查克拉忍术，不过佐助对这点开发的并不是很好，以至于在和鸣人终结谷之战中也只是使用了雷和火两种属性的查克拉变化。

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