如懿入宫后，因为坚守“情分”二字，面对后宫纷争，一直都是佛系态度，不愿意也不屑于宫斗。但这种态度，随着十三阿哥的夭折而发生改变。

如懿怀的十三阿哥，一度被乾隆认为是祥瑞之子，但这个孩子却因为魏嬿婉的算计而夭折了，事后乾隆听信挑拨，认为是如懿的命硬克死了这个孩子，如懿虽然觉得天象之说不可信，但看见乾隆深信不疑，她也没有办法。

如懿为了揭开真相，便让凌云彻偷偷在暗中调查。但魏嬿婉早有预谋，利用田嬷嬷的儿子和海兰的侄子扎齐，将此事嫁祸给海兰，说是海兰为了永琪的前程，买通田嬷嬷下的黑手。海兰因此被打入了慎刑司。但如懿却不相信海兰会这么做，她想到乾隆之所以会这么相信天象之说，就是因为意欢的十阿哥一事的缘故，而当时说十阿哥克父的钦天监是魏嬿婉引进来的。如懿心下了然，开始谋划揪出幕后凶手替海兰洗刷冤屈。

海兰在慎刑司要求见如懿，如懿却当着众妃嫔的面 对海兰的请求置之不理，一副相信了海兰是幕后真凶的样子。如懿的态度，让魏嬿婉放松了警惕。日子一天一过去，魏嬿婉肚子越来越大，生产在即，她的家人便入了宫探望。如懿等的就是这个机会。她趁魏嬿婉娘家没有人时，便命人在魏家的院子里，埋下巫蛊布偶，之后又让李玉去搜查，李玉便将这个肚腹隆起，肚子上扎满银针，背后写着如懿生辰八字的布偶交给乾隆。乾隆看见魏嬿婉娘家居然用巫蛊之术谋害皇嗣，非常恼怒。如懿这么做，是因为她觉得乾隆听信天象之说，当然也会信巫蛊之术害人伤子一说。

而后如懿又借机叫走了魏嬿婉的母亲。而魏嬿婉的弟弟，则更是一早被凌云彻押到了慎刑司。魏嬿婉的母亲在如懿、乾隆的审问下，很快就露出了马脚。而凌云彻这边，也呈上了魏嬿婉弟弟的供词，交代了如何收买扎齐嫁祸海兰的事。当魏嬿婉知道这一切的时候，已经晚了，她为了自保，“壮士断腕”，以弟弟的性命为要挟，让她的母亲揽下所有罪责，但多疑的乾隆并不相信此事完全与她无关，在下令将她母亲处死，弟弟流放后，又下令将魏嬿婉降为答应，生的孩子也被抱给颖妃抚养。