11月20日（周日），东都体育场。江户川柯南与少年侦探团和灰原一起观赏着足球比赛。另一边，同一时刻。突然间，毛利侦探事务所接到了预告大规模爆炸的电话。这不是游戏或虚张声势。像是在挑衅小五郎一般，路上的汽车在眼前爆炸。阻止的方法，只有一个。解读犯人留下的神秘暗号！

炸弹究竟在何处？小五郎、小兰和目暮警部一起在米花市内来回奔波，却被暗号戏弄，完全找不到线索。剩余时间，是45分钟。通过被逼入绝境的小兰打来的电话得知爆炸预告的柯南（新一），开始独自解读暗号。究竟能否解读暗号？即使被逼到绝望的状况，也不会放弃解决案件的柯南，却在爆炸的气浪中，让犯人逃跑了……

嫌疑人是足球选手、支持者、俱乐部老板、媒体业界……都是和足球界有很深关联的人。柯南推理出犯人是有计划性的，为了阻止下一次爆炸，他开始独自调查。因为找不到线索，调查很困难，但犯人再一次向小五郎发去了挑战书。12月“X Day”。下一个目标在哪里？犯人究竟是谁？犯人为什么盯上了小五郎？柯南成功地解读了挑战书中隐藏的暗号，但同时了解到了“某件事”。那是被布置在这起案件中的恐怖阴谋！