职务来看，关羽最高时前将军，五虎上将。秦琼投李渊后，上柱国大将军，破窦建德后翼国公，当朝一品。

再从同时代对手与历史环境看，二人都逢乱世，关羽所处年代顶尖名将有：典韦、张辽、文鸳，马超、张飞、吕布、孙策、赵云、黄忠、许诸等，面对这些人关羽做不到无敌。

隋唐顶尖名将开隋九老中：高颎、贺若弼、鱼俱罗、韩擒虎、杨素；杨林、武建章、邱瑞和定延平则是虚构人物。18条好汉李元霸、宇文成都、裴元庆、雄阔海、伍天锡、伍云昭、杨林、尚师徒、新文礼、魏文通、梁师泰、定延平、左天成为虚构人物：秦琼、罗成、尉迟敬德、来呼尔、单雄信是真实人物，真实名将中，秦琼孤独求败。

人品上：秦琼是隋唐六义首义，绰号“赛孟尝”，心地善良，为人谦恭低调，从不炫耀或滥用特权。

秦琼在凌烟阁排名最后及历史上没有关公名气大，是这两个原因。

1，秦琼投的是李渊不是李世民，不属于李世民嫡系，当时病重也没有参加“玄武门兵变”，长孙无忌、尉迟敬德，杜如悔、房玄龄、侯君集这些人基本都是靠玄武门兵变排名靠前，凌烟阁643年建起时，秦琼已死了五年。官职上也能看出，秦琼刚死，翼国公就贬为三品右武卫大将军，最后才追溢胡国公。

2，秦琼和赵云般没有独立统兵，一直随秦王征战，关羽镇守荆州一直独立统兵作战，军事段位高。

综上所述，关羽是武圣，秦琼是门神，个人武力值考量，关羽不是秦琼对手。