塞瓦斯托波尔空间站

迈克尔·毕晓普·维兰德（《异形2》中仿生人“主教”的原型）出生，当时维兰德家族已经基本失去了对集团的控制权，董事会只给维兰德家族保留了一个荣誉董事的席位，但是长大后的迈克尔·维兰德年轻时就展现出了非凡的天赋，不但带领家族重新掌握了集团的控制权，还拓展了公司与军方的合作项目。

一艘叫做安妮斯朵拉号的私人深空打捞船停泊在了塞瓦斯托波尔空间站的泊位上，它早先在Zeta-网罟座星区收集残骸的时候意外找到了诺斯特罗莫号的残骸，在其中发现了飞行记录仪。安妮斯朵拉号的船员希望通过飞行数据找到整艘飞船和它拖运的货物，但是信标将他们引向了LV-426.....

在星球表面他们遭遇了类似的事情，一名船员被抱脸虫袭击，不过他们将其置于冬眠舱内，希望能就近寻求医疗协助，于是他们来到了塞瓦斯托波尔空间站。

安妮斯朵拉号深空打捞船

艾伦·蕾普利的女儿阿曼达·蕾普利已经25岁，同样为维兰德·汤谷集团工作。她偶然间得知塞瓦斯托波尔空间站可能寻获了其母亲当年服役的诺斯特罗莫号的飞行记录仪，她决定搭乘多伦斯号运输船前往那里探明真相。

阿曼达·蕾普利

但是登上空间站后发现那里已经发生了变故，有一种异形生物正在袭击人类，而大部分空间站工作人员要么已经死亡，要么成了东躲西藏为了求生而变得狂乱的拾荒者。

几番死里逃生的经历后，阿曼达·蕾普利发现公司其实想要保证空间站上那些异形的安全而置员工的安危于不顾，她决定消灭空间站上所有的异形和它们的卵。

在一些船员的帮助下，阿曼达·蕾普利成功用反应炉摧毁了异形的巢穴，但是由于引擎超负荷，轨道维持系统失灵，塞瓦斯托波尔空间站最后坠入了KG-348的巨大气态云层。

阿曼达·蕾普利搭乘的多伦斯号上也出现了异形，她穿上太空服将自己和异形一同吹出了飞船.....

阿曼达·蕾普利

阿曼达·蕾普利在漂浮了3天后被维兰德公司派出的紧急医疗队寻获，他们将其带往一处秘密研究机构，曼德尔空间站，她发现维兰德公司已经获得了异形的基因样本并试图培养自己的异形。

回到地球的阿曼达·蕾普利执着于揭露维兰德·汤谷集团的阴谋，但是苦于没有证据，而且集团在地球上的影响力也不是一个普通的机械工程师可以扳倒的。