拆弹（原作承认）

炸弹的剧情从《新干线大爆破事件》开始就有，但柯南亲自拆弹还是在第一部剧场版《计时引爆摩天楼》中才出现，不过在后续的“震撼警视厅——1200万人质”系列中也再次上映，所以这个能力还是有的。

绝对音感（原作未承认）

因为柯南这个角色太过完美，于是青山刚昌给了他一个音痴的缺点，但后来又给了“绝对音感”？这点的话其实是剧场版M12《战栗的乐谱》为了能迎合剧情强行加戏，甚至达到了离谱的阶段，在原作中并未承认。

柯南的很多推理会运用到音乐知识，但是他自己却是完全都听不出旋律的。像是在421集《斯托拉地巴力欧斯不和谐音》终曲中，柯南从音阶排列顺序是CDEFGAB而不是ABCDEFG从而推理出了凶手的*人顺序，但他却没有听出《七子之歌》的旋律，也就是手机按键的旋律是7656还是3212也完全听不出，只能跑去问音乐家。